Overig
alle pijlers
Is er een natuur- of scheikundige in de zaal?
vrijdag 28 april 2023 om 21:28
Het feit dat ik niet weet of ik een natuurkundige of een scheikundige zoek geeft wel aan hoe een nitwit ik ben in de materie 
. En wellicht heb ik een andere 'kundige' nodig 
Het is een vraag die me bezighoudt.
Veel supplementen op de markt zijn synthetisch van aard. Zo heb ik bijvoorbeeld begrepen dat magnesium malaat een verbinding is van magnesium en malic acid. Een aminozuur. Degene die mij dat uitlegde, een Engelsman, gaf aan dat dit aminozuren per definitie in een laboratorium worden gemaakt, juist omdat aminozuren makkelijk te maken zijn. Ze zijn dan wel identiek (waaraan vertelde hij niet en ik kan het hem ook niet meer vragen).
Maar ik vraag me dan dus af, waar worden die aminozuren in een laboratorium dan van gemaakt? Wat is de grondstof? Hoe worden ze identiek? En waaraan? En als het synthetisch is, hoe weet je dan dat het gezond is voor je lichaam?
Wellicht een gekke vraag voor de vrijdagavond, maar ik ben hier zo benieuwd naar (en mijn kennis ligt op een geheel ander vlak).
. En wellicht heb ik een andere 'kundige' nodig Het is een vraag die me bezighoudt.
Veel supplementen op de markt zijn synthetisch van aard. Zo heb ik bijvoorbeeld begrepen dat magnesium malaat een verbinding is van magnesium en malic acid. Een aminozuur. Degene die mij dat uitlegde, een Engelsman, gaf aan dat dit aminozuren per definitie in een laboratorium worden gemaakt, juist omdat aminozuren makkelijk te maken zijn. Ze zijn dan wel identiek (waaraan vertelde hij niet en ik kan het hem ook niet meer vragen).
Maar ik vraag me dan dus af, waar worden die aminozuren in een laboratorium dan van gemaakt? Wat is de grondstof? Hoe worden ze identiek? En waaraan? En als het synthetisch is, hoe weet je dan dat het gezond is voor je lichaam?
Wellicht een gekke vraag voor de vrijdagavond, maar ik ben hier zo benieuwd naar (en mijn kennis ligt op een geheel ander vlak).
I will not let anyone walk through my mind with their dirty feet.
- Gandhi
- Gandhi
zaterdag 29 april 2023 om 00:16
Yella78 schreef: ↑28-04-2023 23:57Heel interessant, maar de hamvraag is volgens mij nog niet beantwoord en ik ben er ook benieuwd naar: wat gebruik je dan als bron/grondstof om iets te gaan maken in het lab? Stel, je wilt vitamine D-tabletten gaan maken. Waar begin je dan mee, wat precies stop je in het reactievat/de reageerbuis/de erlenmeyer/het petrischaaltje voordat het synthetisatieproces gaat beginnen?
Wat de grondstoffen zijn, verschilt dus met wat je uiteindelijk wil maken.
Voor vitamine D(3), dat is vaak afkomstig van lanoline, dat vet of wasachtige substantie in schapenwol. UIt die lanoline halen ze 7-dehydrocholesterol, wat ook de voorganger van vitamine D in je eigen lichaam is. De reactie van 7-dehydrocholesterol tot vitamine D vindt plaats door UV-straling, wat in het lab nagedaan kan worden óf de chemische reactie kan op een andere manier gekatalyseerd worden.
Voor plantaardige productie wordt de (voorganger van) vitamine D3 uit algen gehaald. Ook vitamine D kan trouwens gemaakt worden door schimmels en gisten. Ook hier weer veel verschillende methodes dus
Wat er vervolgens precies inzit aan vulmiddelen en hoe ze het tot pilletje persen, geen idee.
"Wine in the morning, and some breakfast at night. Oh baby, I'm beginning to see the light!"
zaterdag 29 april 2023 om 00:16
Oh! En alvast het antwoord op de volgende vraag: Maar hoe zie je dat dan, alles is toch itty bitty tiny?Ugli schreef: ↑29-04-2023 00:01Een receptor heeft een bepaalde vorm. Zeg maar zoals een slot. Het is dus een kwestie van een sleutel maken die in dat slot past. Als je weet hoe de sleutel die eigenlijk bij die receptor hoort is opgebouwd (door de moleculaire structuur uit te pluizen), kun je die sleutel namaken.
Die vraag over het gif weet ik niet, dat is te chemisch voor mij. Mijn noob gedachte is dat dat gif in het geval van Diabetes type 1 de rol van insuline over neemt dus dan ga ik kijken naar insuline receptoren en kijken of ik daar gifdeeltjes op zie plakken. Of in het geval van Diabetes type 2 plakt hij aan de insuline receptor maar zet hij wél het signaal door, in tegenstelling tot het insuline wat alleen maar de receptoren bezet loopt te houden en niks meer doet.
Mega microscopen en lichtgevende verf.
Ik klieder dan wat verf op het gif (minder visueel uitgelegd: Ik hang een radioactieve of een fluoriserende marker aan het gif molecuul) en dan zie ik hem wel ergens verschijnen onder mijn microscoopje.
zaterdag 29 april 2023 om 00:17
LaFolie schreef: ↑28-04-2023 23:43Klopt, iedere set van 3 nucleotiden (een A, C, G of U) vormt een 'codon' op het mRNA. Dit mRNA wordt in die kloppende volgorde afgelezen. Ieder drietal, dus ieder codon, geeft eigenlijk instructies voor een bepaald aminozuur.
Die aminozuren samen, achter elkaar, worden gelinkt in één ketting, een poypeptideketen. Variërend in grootte en volgorde, vormt het dan uiteindelijk een eiwit.
Dit is ook waarom mutaties soms een negatief effect kunnen hebben: zet er één foute nucleotide tussen die daar eigenlijk niet hoort, en de leesvolgorde van de setjes van drie verandert. En dan wordt er dus steeds een verkeerd aminozuur aangedragen, waardoor er uiteindelijk geen of een verkeerd eiwit gemaakt wordt.
Sorry, mijn vrienden in het dagelijks leven zijn hier nooit in geïnteresseerd maar het is ongeveer het leukste op de hele wereld
Misschien handig om erbij te vertellen wat mRNA eigenlijk is.
Ik heb voor het gemak even copy/paste van Wiki gedaan, met wat kleine aanpassingen. Voor de beeldvorming; dit speelt zich allemaal in de lichaamscel af:
Messenger-RNA (in het Nederlands af en toe boodschapper-RNA genoemd), afgekort mRNA, speelt een centrale rol in het tot expressie brengen van genetische informatie. Messenger-RNA is een vorm van RNA die als 'boodschapper' (messenger) twee processen met elkaar verbindt: de transcriptie, waarbij een stuk DNA (een gen) overgeschreven wordt tot mRNA, en de translatie, waarbij het mRNA wordt vertaald naar een keten van aminozuren (een eiwit).
Ik heb dit ook allemaal in mijn studie gehad en heb toen een enorm ontzag voor het menselijk lichaam gekregen. Het is echt wonderbaarlijk hoe het werkt.
zaterdag 29 april 2023 om 00:18
Ja, dat is duidelijk, maar waar haal je die bouwsteentjes voor, in dit geval, vitamine D vandaan? Waar bestaat het uit? Wat is je grondstof die je vervolgens via chemische reacties omvormt?
Ik herinner het me van salmiak, haha. Magisch vond ik het vroeger bij een scheikundeles, de docent voegde ammoniakgas en zoutzuurgas bij elkaar en floep, daar dwarrelde salmiakpoeder neer.
Dat is denk ik waar TO ook op doelde: je wilt een stof gaan maken in het lab of, groter gedacht, de fabriek. Om de chemische reactie op gang te brengen moet je met andere stoffen dan het eindresultaat beginnen en natuurlijk verschilt dat per gewenst eindresultaat. Maar wát precies gebruik je dan bijvoorbeeld voor het maken van een vitamine, een medicijn et cetera, los van hulpstoffen. Waar begin je mee? (en natuurlijk is dat bij elke stof weer iets anders)
Ik herinner het me van salmiak, haha. Magisch vond ik het vroeger bij een scheikundeles, de docent voegde ammoniakgas en zoutzuurgas bij elkaar en floep, daar dwarrelde salmiakpoeder neer.
Dat is denk ik waar TO ook op doelde: je wilt een stof gaan maken in het lab of, groter gedacht, de fabriek. Om de chemische reactie op gang te brengen moet je met andere stoffen dan het eindresultaat beginnen en natuurlijk verschilt dat per gewenst eindresultaat. Maar wát precies gebruik je dan bijvoorbeeld voor het maken van een vitamine, een medicijn et cetera, los van hulpstoffen. Waar begin je mee? (en natuurlijk is dat bij elke stof weer iets anders)
Wat gij niet wilt dat u geschiedt, doe dat ook een ander niet.
zaterdag 29 april 2023 om 00:22
Dat legt LaFolie toch uit?Yella78 schreef: ↑29-04-2023 00:18Ja, dat is duidelijk, maar waar haal je die bouwsteentjes voor, in dit geval, vitamine D vandaan? Waar bestaat het uit? Wat is je grondstof die je vervolgens via chemische reacties omvormt?
Ik herinner het me van salmiak, haha. Magisch vond ik het vroeger bij een scheikundeles, de docent voegde ammoniakgas en zoutzuurgas bij elkaar en floep, daar dwarrelde salmiakpoeder neer.
Dat is denk ik waar TO ook op doelde: je wilt een stof gaan maken in het lab of, groter gedacht, de fabriek. Om de chemische reactie op gang te brengen moet je met andere stoffen dan het eindresultaat beginnen en natuurlijk verschilt dat per gewenst eindresultaat. Maar wát precies gebruik je dan bijvoorbeeld voor het maken van een vitamine, een medicijn et cetera, los van hulpstoffen. Waar begin je mee? (en natuurlijk is dat bij elke stof weer iets anders)
Edit: Oh.
Nou je hebt je antwoord dus.
zaterdag 29 april 2023 om 00:23
Ugli, jaaah! Die receptoren! 
Om even de link te leggen tussen de mRNA van LaFolie en de receptoren van Ugli:
aan de buitenkant van een cel zitten verschillende soorten recepteren - komt er een molecuul langs die past (sleutel/slot) op een receptor - dan kan dat zomáár een trigger IN de cel zijn voor het DNA om er mRNA van te maken, daarmee weer een aminozuur - die vervolgens weer ergens een functie heeft. Het is oneindig gecompliceerd én vernuftig.
Om even de link te leggen tussen de mRNA van LaFolie en de receptoren van Ugli:
aan de buitenkant van een cel zitten verschillende soorten recepteren - komt er een molecuul langs die past (sleutel/slot) op een receptor - dan kan dat zomáár een trigger IN de cel zijn voor het DNA om er mRNA van te maken, daarmee weer een aminozuur - die vervolgens weer ergens een functie heeft. Het is oneindig gecompliceerd én vernuftig.
courage wijzigde dit bericht op 29-04-2023 00:27
84.34% gewijzigd
zaterdag 29 april 2023 om 00:23
Ugli schreef: ↑29-04-2023 00:16Oh! En alvast het antwoord op de volgende vraag: Maar hoe zie je dat dan, alles is toch itty bitty tiny?
Mega microscopen en lichtgevende verf.
Leuk!! Ik zit helemaal niet aan de biomedische kant, maar vind dat wel ontzéttend boeiend
"Wine in the morning, and some breakfast at night. Oh baby, I'm beginning to see the light!"
zaterdag 29 april 2023 om 00:33
En het is nog veel interessanter: Iedereen weet dat je DNA je blueprint is, want dat zijn je genen toch? Nou, die genen zijn maar 5% van je DNA. 95% van je DNA codeert niet voor genen, daardoor vroeger ook wel junk DNA genoemd. Waarvoor dan wel? Een groot deel is onbekend, een groot deel zijn gekke restjes van virussen die zich ooit genesteld hebben of random repeterende delen. Een ander groot deel maakt RNA maar géén mRNA. mRNA is wat je genen vertaalt naar eiwitten. Nee, dit RNA doet dat niet. Het blijft RNA en beslist of dat mRNAtje wat zo liefdevol gebouwd is, wel een aminozuurtje mag worden. Het loopt een beetje politieagentje te spelen dus. Heb je een gen en is hij eindelijk vertaald naar iets waarmee een eiwit gebouwd kan worden, wordt ie zo neergeklapt! Ik vind dat hele “junk DNA” nog veel boeiender dan het stukje coderend DNA. Ook omdat er organisme soorten zijn die nauwelijks “junk DNA” hebben en dat schijnbaar dikke priem vinden.Courage schreef: ↑29-04-2023 00:17Misschien handig om erbij te vertellen wat mRNA eigenlijk is.
Ik heb voor het gemak even copy/paste van Wiki gedaan, met wat kleine aanpassingen. Voor de beeldvorming; dit speelt zich allemaal in de lichaamscel af:
Messenger-RNA (in het Nederlands af en toe boodschapper-RNA genoemd), afgekort mRNA, speelt een centrale rol in het tot expressie brengen van genetische informatie. Messenger-RNA is een vorm van RNA die als 'boodschapper' (messenger) twee processen met elkaar verbindt: de transcriptie, waarbij een stuk DNA (een gen) overgeschreven wordt tot mRNA, en de translatie, waarbij het mRNA wordt vertaald naar een keten van aminozuren (een eiwit).
Ik heb dit ook allemaal in mijn studie gehad en heb toen een enorm ontzag voor het menselijk lichaam gekregen. Het is echt wonderbaarlijk hoe het werkt.
En dan heb ik het nog niet eens gehad over het DNA wat niet in je eigen DNA helix zit maar in je mitochondrien, de energiefabriekjes van je cel. Het is niet eens een helix, maar een ringetje. Het idee is dat deze dingetjes ooit op zichzelf levende organismen waren en op een gegeven moment zijn komen buurten in onze cellen, vandaar dat ze nog hun eigen DNA hebben. Maar dat DNA is geen troepje overgebleven uit wilde verledes, nee dat DNA doet dingen. En nog veel boeiender: Dat DNA erf je. Niet netjes van beide ouders zoals gewoon DNA, nee, je erft het enkel van je moeder. En fouten in dit DNA brengen ziektes/syndromen met zich mee, die eveneens overgeërfd kunnen worden, maar alleen als je een vrouwtje bent.
ugli wijzigde dit bericht op 29-04-2023 00:57
3.57% gewijzigd
zaterdag 29 april 2023 om 00:40
Nou moet ik eerlijk toegeven dat ik het erg kleurrijk vertel. Er is echt fluoriserende verf en mega receptoren, maar je zit dus wel naar kleurensoep te kijken waar je maar sense van moet maken:
Dit zijn een clubje witte bloedcellen bijvoorbeeld. Ieder eiwitje heeft een eigen kleurvlaggetje gekregen.
zaterdag 29 april 2023 om 00:44
Je 'mag' het tegenwoordig ook geen junk DNA meer noemen
"Wine in the morning, and some breakfast at night. Oh baby, I'm beginning to see the light!"
zaterdag 29 april 2023 om 00:46
Ugli schreef: ↑29-04-2023 00:40Nou moet ik eerlijk toegeven dat ik het erg kleurrijk vertel. Er is echt fluoriserende verf en mega receptoren, maar je zit dus wel naar kleurensoep te kijken waar je maar sense van moet maken:
*knip*
Dit zijn een clubje witte bloedcellen bijvoorbeeld. Ieder eiwitje heeft een eigen kleurvlaggetje gekregen.
Gaaf
!
"Wine in the morning, and some breakfast at night. Oh baby, I'm beginning to see the light!"
zaterdag 29 april 2023 om 00:47
Het bladgroen van planten, dat waarmee ze fotosynthese kunnen doen, zijn net zoals mitochondriën ook ooit op zichzelf staande organismen geweest die in planten zijn komen chillen. En die hebben ook nog hun eigen DNA, ook een ringetje (bacteriën hebben ook een ringetje als DNA trouwens, toevallig toevallig).
zaterdag 29 april 2023 om 00:55
Nee. Het is niet voor niks dat wij 98.9% DNA met een chimp kunnen delen, 85% met een muis en ik las ergens 50% met een banaan en en er toch zo godvergeten anders uit zien. Die genen zijn het spannendste niet, hoe ze gereguleerd worden is veel cooler.
zaterdag 29 april 2023 om 06:23
zaterdag 29 april 2023 om 12:06
Als je uitvindt dat gif helpt dan ga je het gif scheiden in zijn verschillende moleculen, bijvoorbeeld dmv chromotografie. Als je dan losse componenten hebt ga je weer testen welke component of combinatie van componenten het juiste effect heeft op de diabetes. Dan ga uitzoeken hoe die component is opgebouwd mbv analysetechnieken, zoals bijvoorbeeld NMR, IR, massaspectometrie etc. Als je weet hoe het opgebouwd is kun je gaan bedenken hoe je het opbouwt uit bepaalde grondstoffen en welke reacties je dan moet doen om alle atomen op de juiste manier aan elkaar te knopen. En dat ga je dan proberen, om te zien of het lukt. En dan met het gesynthetiseerde molecuul nogmaals checken of het ook inderdaad werkt.Ipstwee schreef: ↑28-04-2023 23:47We hebben een biochemicus nodig. En een moleculair bioloog.
Ik werk zelf in onderzoek naar nieuwe geneesmiddelen en ik ben ook nog steeds zo benieuwd hoe ze al die nieuwe stofjes maken in het lab; als je bijvoorbeeld uitvindt dat het gif van een gilamonster kan helpen tegen diabetes, hoe weet je dan wélk stofje dat precies is en hoe maak je het na? Of in de oncologie, hoe maak je nu een medicijn dat aangrijpt op een bepaalde receptor?
Zo heb ik het geleerd. Dat is wel ruim 25 jaar geleden en ik heb me gespecialiseerd in een andere richting van de scheikunde, dus de nieuwere ontwikkelingen ken ik niet.
zaterdag 29 april 2023 om 12:06
Welke grondstoffen er voor aminozuren gebruikt worden hangt af van welk aminozuur je wil maken, welke stappen je uit kunt voeren in je productieproces en vermoedelijk ook hoeveel het kost (grondstoffen, energie, aantal benodigde stappen). Maar ik heb zelf niet in die richting gewerkt, dus ik ben waarschijnlijk niet volledig in deze opsomming.
aikidoka wijzigde dit bericht op 29-04-2023 12:31
85.76% gewijzigd
zaterdag 29 april 2023 om 13:16
Nou ja heel aggressief is hij ook niet, hij is vooral plakkerig. Het RNA uit “Junk DNA” heeft de complementaire samenstelling van het neer te klappen mRNA. Zeg maar zoals klittenband: De ene kant plakt aan de andere kant vast omdat ze complementair zijn en dan kan het klittenband nergens anders meer aan plakken. Zo plakt dat RNA aan het mRNA en dan heb je zomaar ineens weer een dubbel strandse streng wat niet meer gelezen kan worden om eiwitjes te bouwen, maar er wel anders uit ziet dan gewoon DNA. Die wordt herkent door een ander eiwit en die gaat die streng vervolgens kapot knippen. Ik heb het nu ook over slechts 1 type RNA uit “Junk DNA”, namelijk siRNA. Ik dacht het is al infodiarree genoeg zo, haha! Je hebt nog meer andere types, eentje heet snRNA en knipt de niet-coderende stukjes (intronen) uit je genen, dus die helpt juist weer bij genexpressie. En dan heb je nog miRNA die juist weer uitstaat vanuit die intronen en zowel genexpressie tegen kan houden als versterken, afhankelijk van hoe hij gebouwd is en waar hij vast gaat plakken. En zo heb je er nog meer, je hebt zelfs speciaal DNA (miDNA).
Om te kunnen reageren moet je ingelogd zijn
Al een account? Log dan hier in
